El programa de Formación en Cirugía Pediátrica de la Universidad de Valparaíson es un programa pionero en el ámbito nacional al incluir dentro de su formación un primer año por Cirugía General de Adultos, completando un total de 4 años. Además, el programa posee un sello en la realización de investigación en cirugía pediátrica. 

El programa de Formación en Cirugía Pediátrica de la Universidad de Valparaíso fue en primer programa de especialidad médica en ser acreditado por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) en Chile, otorgándosele una acreditación por 7 años vigente hasta Agosto del 2025. En los últimos cuatro años, el Comité Curricular del Programa ha trabajado en conjunto con la Oficina de Educación Médica de la Escuela de Medicina y con la Dirección General de Postgrado y Postítulo  de la Universidad, en el proceso de innovación curricular, de tal manera de actualizar la formación del Especialista en Cirugía Pediátrica a un programa orientado por competencias. Este programa innovado entró en vigencia el 3 de Abril del 2025 (Res. (80.691/2025)