El programa de Formación en Cirugía Pediátrica de la Universidad de Valparaíson es un programa pionero en el ámbito nacional al incluir dentro de su formación un primer año por Cirugía General de Adultos, completando un total de 4 años. Además, el programa posee un sello en la realización de investigación en cirugía pediátrica. 

El programa de Formación en Cirugía Pediátrica de la Universidad de Valparaíso fue recientemente reacreditado por la Comisión Nacional de Acreditación (CNA) por un periodo de 8 años, hasta el 11 de Marzo 2034. El programa de Formación en Cirugía Pediátrica fue en primer programa de especialidad médica en ser acreditado en Chile por la CNA en el año 2018. En esta segunda acreditación lo hizo bajo los nuevos y más exigentes estándares.

El programa innovado de Formación en Cirugía Pediátrica se actualizó a una formación basada en competencias según el modelo educativo de la Universidad de Valparaíso (Res. 80.691/2025). Dentro de las características del programa se encuentra que incorpora desde hace más de 25 años un primer año por Cirugía General de Adultos, completando un total de 4 años. Además, el programa posee un sello relevante en la realización de investigación en cirugía pediátrica. Dentro de las innovaciones del programa actualizado están la realización de dos cursos de simulación en cirugía mínimamente invasiva: uno básico y uno avanzado y las realización de evaluaciones periódicas con retroalimentación a los residentes en todos los roles que implica su desempeño como especialista, ajustada a su etapa de formación.